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      在線工具
      為了方便廣大科研工作者對各類編碼和非編碼RNA做結構或序列分析、注釋、預測基因靶標、功能查詢等生物信息學內容,我們在此匯集了許多常用的在線工具。 RiboBio Galaxy 生信分析平臺致力于解決生物信息分析中常見的文本處理、格式轉換、以及數據可視化等問題
      EXORBASE

      EXORBASE是由人血液外體的RNA SEQ數據分析衍生的環狀RNA(CyCRNA)、長非編碼RNA(LNCRNA)和信使RNA(mRNA)的儲存庫,還包括來自已發表文獻的實驗驗證。EXORBASE基于正常人和不同疾病患者的標準化RNA SEQ數據,整合和可視化RNA表達譜。EXOBASE的目的是收集和表征人類血液外體中的所有長RNA物種。提供了注釋、表達水平和可能的原始組織。EXORBASE將幫助研究人員識別血液外體中的分子標記,并將觸發新的循環生物標志物發現和人類疾病的功能含義。

      了解更多:http://www.exorbase.org/

      miRBase 21.0

      miRBase序列數據庫是一個提供包括 miRNA 序列數據、注釋、預測基因靶標等信息的全方位數據庫,是 miRNA 研究權威數據依據之一。microRNA 21 0版是最新版本,新版數據庫的可靠性進一步提升,總計,新增了4196條發夾前體序列和5441條成熟miRNA,并清除了一些不明確的和錯誤注釋的序列。

      了解更多:http://www.mirbase.org/search.shtml

      NCBI

      NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美國國立生物技術信息中心,NCBI研究小組包括計算機科學家,分子生物學家,數學家,生物化學家,實驗物理學家,和結構生物學家,集中于計算分子生物學的基本的和應用的研究。這些問題包括基因的組織,序列的分析,和結構的預測。目前研究計劃的一些代表是:檢測和分析基因組織,重復序列形式,蛋白domain和結構單元,建立人類基因組的基因圖譜,HIV感染的動力學數學模型,數據庫搜索中的序列錯誤影響的分析,開發新的數據庫搜索和多重序列對齊算法,建立非冗余序列數據庫,序列相似性的統計顯著性評估的數學模型和文本檢索的矢量模型。另外,NCBI研究者還堅持推動與NIH內部其他研究所及許多科學院和政府的研究實驗室的合作。

      了解更多:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

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